🔬 Исследователи обнаружили, что нарушение работы белковых комплексов BAF меняет пространственную организацию ДНК: в 20 из 21 изученной клеточной линии доступнее становились участки связывания белка CTCF. Работа опубликована в Nature и описывает механизм, который может связывать потерю функции BAF с изменениями активности генов при раке.
Авторы подавляли работу BAF веществом FHD-286 и нарушали функцию гена ARID1A, кодирующего одну из частей комплекса cBAF. Затем измеряли доступность хроматина, связывание белков и контакты между участками ДНК. После потери cBAF белок CTCF и комплекс когезин чаще связывались с хроматином, хотя количество самого CTCF не увеличивалось.
Карты контактов ДНК показали, что крупные пространственные области делились на меньшие, с более выраженными границами. Дальние контакты между энхансерами и промоторами сменялись более короткими связями рядом с промоторами. Другой комплекс, PBAF, напрямую взаимодействовал с CTCF и поддерживал эту перестройку; нарушение работы PBAF частично возвращало организацию хроматина к исходной.
У мышей потеря одной копии Arid1a увеличивала долю активно делящихся B-клеток в тёмной зоне зародышевых центров. Одновременная потеря одной копии Ctcf или Pbrm1 устраняла этот сдвиг. Это поддерживает вывод, что изменения после потери cBAF зависят от CTCF и PBAF.
✅ Работа предлагает механизм, через который нарушения BAF могут перестраивать геном и поддерживать ускоренное деление клеток. Однако основные эксперименты проведены на клеточных моделях и мышах, а эффект зависит от типа клеток: авторы отмечают, что в других исследованиях T-клеток роль PBAF оказалась иной.
⚕️ Это не медицинская рекомендация.
