🔬 Авторы работы в Nature составили карту взаимодействий жизненно важных генов возбудителя туберкулёза. Они исследовали 762 гена Mycobacterium tuberculosis и в одном из экспериментов выявили почти 6 500 взаимодействий. Карта помогла предсказать, какие сочетания веществ усиливают действие друг друга против бактерии, а какие, напротив, мешают ему.
Команда с помощью CRISPR-интерференции снижала активность двух генов одновременно и измеряла, как меняется рост бактерий. Результат сравнивали с ожидаемым эффектом, рассчитанным по отдельному подавлению каждого гена. Отклонение в любую сторону указывало на генетическое взаимодействие. Пары отслеживали по генетическим штрихкодам.
Исследователи также построили карту для модельной бактерии Mycobacterium smegmatis. В общей сложности в двух видах они выявили более 15 000 взаимодействий. Гены со сходными функциями часто образовывали группы со схожими связями — это помогло предположить функции некоторых ранее не изученных генов.
Затем авторы проверили предсказания о сочетаниях веществ. В лабораторных тестах подтвердились четыре пары, в которых вещества усиливали действие друг друга, и одна пара, в которой они мешали друг другу. Для одного из сочетаний взаимное усиление подтвердили как на стандартном лабораторном штамме, так и на клинических штаммах разных линий.
✅ Карта может помочь выбирать сочетания противотуберкулёзных препаратов и находить новые мишени для лекарств. Однако подавление гена не полностью воспроизводит действие вещества, а взаимодействия зависят от концентрации. Карты получены в стандартных лабораторных условиях; как эти связи меняются при инфекции, ещё предстоит выяснить.
⚕️ Это не медицинская рекомендация.
