🔬 Авторы исследования в Nature сопоставили 12,8 млн однонуклеотидных вариантов — различий в одной «букве» ДНК кишечных микробов — с 244 показателями здоровья и внешними воздействиями у 10 781 человека. Они выявили 940 независимых связей: генетические различия внутри видов дополняют сведения, которые даёт подсчёт численности бактерий.
Исследователи объединили данные шести когорт: пяти из Нидерландов и одной из Танзании. Они прочитали микробную ДНК в образцах кала и провели анализ с учётом возраста, пола, численности соответствующего вида бактерий и генетического родства между его штаммами. Выявленные связи охватили 101 вид микробов и 69 признаков человека или внешних воздействий; каждый сигнал поддерживали данные как минимум двух когорт.
Для 65,74 % независимых сигналов авторы не нашли значимой связи того же признака с численностью соответствующего вида. Это показывает, какую информацию можно упустить, если изучать только состав микробиома, не учитывая различия в ДНК внутри одного вида.
Один из примеров — варианты гена sarA\_2 у бактерии Faecalibacterium prausnitzii, связанные с возрастом участников. Компьютерное моделирование предполагает, что некоторые замены затрагивают участок белка, способный связывать глутатион. Авторы выдвинули гипотезу, что эти варианты могут влиять на поглощение глутатиона бактерией, но механизм ещё требует экспериментальной проверки.
✅ Открытый каталог результатов поможет выбирать генетические варианты микробов для дальнейших экспериментов. Причинность выявленных связей пока не установлена, а большинство участников — из Нидерландов: для проверки переносимости результатов нужны более крупные выборки из других популяций.
⚕️ Это не медицинская рекомендация.
